医学科研:文献、临床统计与单细胞分析

给医学生、做科研的临床医生和生物医学研究生:先查中英文文献、药品说明和同类临床试验,再定研究设计、样本量和统计方法,然后用生信数据库、测序与单细胞工具做组学分析,最后画机制示意图。只用于科研,不用于诊疗决策。病历和测序数据按单位规定与伦理审批处理,先在本机去标识化,原始数据不要贴进对话或上传第三方服务;数据源多为英文的国际数据库;统计结果和论文结论要请导师或统计师复核。PubMed、BioRender 插件只支持 Claude Code,测序插件只支持 Codex。

11 個資源更新於 2026-10-12

  1. PubMedPlugin查英文文献:通过远程 MCP 服务检索 PubMed 生物医学论文,无需账号。只能在 Claude Code 里安装,用其他 agent 的可改用下面的 Medical MCP Server 查 PubMed;摘要和结论要回原文核对。anthropics/life-sciences621
  2. CNKI SkillsSkill补中文文献:通过浏览器操作知网,可按北大核心、CSCD 等来源筛选,导出 GB/T 7714 引用或推送到 Zotero。需先装 Chrome DevTools MCP;下载要自己登录知网,验证码手动过。cookjohn/cnki-skills994
  3. Medical MCP ServerMCP查药品与指南:检索 FDA、EMA、DailyMed 药品说明和 FAERS 不良事件、WHO 统计与临床指南,文献带按标题摘要自动推断的证据等级。本机需 Node.js,无需 Key;不含国内药品说明书。JamesANZ/medical-mcp118
  4. ClinicalTrials.gov MCP ServerMCP参考同类研究:在 ClinicalTrials.gov 查同病种试验的入排标准、终点和已公布结果,统计试验格局。无需 API Key,本机需 Node.js 24 以上;不含中国临床试验注册中心的数据。cyanheads/clinicaltrialsgov-mcp-server99
  5. MedSci SkillsSkill定方案到投稿前自查:研究设计、样本量、本机去标识化、统计作图;投稿前按 STROBE、CONSORT 等报告规范逐条核对,并核验引文真伪。有简体中文说明,需 Node 18+ 与 Python 3.9+。Aperivue/medsci-skills341
  6. Medical Research Agent SkillsSkill按课题类型找技能:PubMed 检索式、Meta 分析、孟德尔随机化等方案、生信代码、SCI 写作和审稿回复。共 550 多个,把安装命令里的「*」换成要用的技能名;其中 scanpy 与下面的 Scanpy 重名,只装一个。aipoch/medical-research-skills2k
  7. BioMCPMCP查基因变异与肿瘤数据:检索 ClinVar、OncoKB、PubMed 等,可对下载的 cBioPortal 数据做本地生存分析。用 uv(Python 工具管理器)安装;OncoKB 需另申请 Token,部分数据源限制商用或临床用途。genomoncology/biomcp656
  8. ToolUniverseMCP查药物与靶点:一个 MCP 接入上千个科学工具和数据库,适合药物靶点、药物警戒类课题;默认是精简模式,只暴露查找和调用工具的几个入口,节省上下文。本机需 uv,部分数据源要各自申请 API Key。mims-harvard/ToolUniverse1.7k
  9. Life Sciences NGS AnalysisPlugin处理测序原始数据:从 FASTQ 做质控、bulk RNA-seq 定量与差异表达、单细胞计数,并留下运行记录。这是 OpenAI 的 Codex 插件,Claude Code 用不了;需本机生信软件和参考基因组、注释文件,插件会先检查。openai/plugins7.5k
  10. Scanpy Single-Cell AnalysisSkill单细胞分析:用 Scanpy 完成质控、归一化、降维、聚类、找 marker 基因和作图,附一条命令跑完整流程的脚本;Seurat 对象要先转成 h5ad。需 Python 3.12 以上。K-Dense-AI/scientific-agent-skills51.2k
  11. BioRenderPlugin画机制示意图:把 Claude Code 连到 BioRender 的科研图标与模板库,找素材、做汇报和论文配图。需 BioRender 账号并在 /plugin 里授权;免费账号的图不能用于发表或商用,投稿用图要买付费订阅。anthropics/life-sciences621
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